Rådsdirektören ät ställföreträdande generaldirektör och bistår denne i ledningen av myndigheten. Ansvaret innefattar strategiskt ansvar för frågor kopplade till ledning och utveckling samt ansvar för myndighetens processer och rutiner uppdrag.
Vetenskapsrådet är Sveriges största statliga forskningsfinansiär och ger stöd till forskning inom alla vetenskapsområden. Totalt arbetar 250 personer på myndigheten.